Como um dos meios de realizar seus objetivos, a Academia poderá conceder prêmios permanentes ou eventuais.

Medalha de Honra ao Mérito “José Batista Rosa”

• É outorgada aos ingressos nas categorias de Acadêmicos Titulares, Acadêmicos Honorários e Acadêmicos Beneméritos.

Medalha “Acadêmico Samuel Fonseca”

• É concedida a pessoa física ou jurídica, cirurgião-dentista ou não, que tenha prestado relevantes serviços à Academia, à Odontologia ou à comunidade em geral, no âmbito das atividades da saúde.

Mérito Discente

• Destinado a distinguir, por curso de graduação do Estado de Santa Catarina, o aluno que obteve a melhor média durante o curso. É entregue na solenidade de formatura e citada na Sessão Solene da Academia imediatamente após a outorga.

Mérito em Pesquisa

• Objetiva distinguir pesquisador em função do trabalho desenvolvido ou da obra de sua vida de pesquisador.

Mérito Profissional

• Será outorgada a cirurgião-dentista, por especialidade, que se tenha distinguido no exercício profissional.

Mérito em Docência

• Destinado a distinguir professor que se tenha destacado na atividade docente.

Mérito Acadêmico

Será outorgado para:

• Cirurgião-dentista que se tenha distinguido em nível excepcional.
• Serviço Público de Odontologia que se tenha distinguido pela atenção dada à população.
• Atividade industrial e/ou comercial vinculada à Odontologia que se tenha destacado.
• Pessoa não pertencente à profissão e que se tenha distinguido em assuntos vinculados à Odontologia.

Menção Honrosa

• Destinada a salientar o mérito de pessoa ou entidade que produzir obra ou desenvolver atividade que, no julgamento da Diretoria, mereça imediato reconhecimento da Academia e registro em seus anais.